Что представляет собой КОР-ФЕРМЕНТ РНК-полимеразы E.Coli ?

ПЕРВАЯ группа субъединиц ответственна за катализ реакций синтеза полинуклеотидной цепочки (КОР-ФЕРМЕНТ - МИНИМАЛЬНЫЙ или НЕПОЛНЫЙ ЭНЗИМ) конституитивные субъединицы, составляющие основу фермента, называемую кором.

Молекулярный вес 400.000 487 кДа состоит из 5 полипептидных цепей:

1. две альфа цепи (альфа-1 и альфа-2) каждая по 9.000 - 40.000

2. одна бетта цепь 155.000

3. одна бетта штрих цепь 165.000

4. одна омега цепь 16.000 80 кДа

Катализирует синтез цепи РНК беспорядочно и медленно

Структура, сочетавшая субъединицы, обозначенные в пунктах 1,2,3, способна выполнять лишь уже начатую ЭЛОНГАЦИЮ

По нуклеотидной последовательности генов реконструирована полная аминокислотная последовательность каждой субъединицы РНК-полимеразы Е. coli.

Методом фут-принтинга установлено, что при взаимодействии с ДНК фермент "закрывает" 60 пар нуклеотидов.

В чём состоят функции белковых субъединиц КОР-ФЕРМЕНТА

РНК-полимеразы E.Coli ?

Полный молекулярный вес КОР-ФЕРМЕНТА 400.000 состоит из 5 полипептидных цепей:

1. две альфа цепи (альфа-1 и альфа-2) каждая по 9.000 - 40.000

выполняет функцию КАРКАСА, осуществляет безматричный синтез

ГОМОПОЛИМЕРОВ

2. одна бетта цепь 155.000 необходима для инициации и элонгации РНК

3. одна бетта-штрих цепь 165.000 принимает участие в поддержании связи

РНК-полимеразы с матрицей

4. одна омега цепь 16.000 принимает участие в связывании РНК-полимеразы с матрицей

Структура, сочетавшая субъединицы, обозначенные в пунктах 1,2,3, способна выполнять лишь уже начатую ЭЛОНГАЦИЮ

Каков механизм действия ингибитора РНК-полимеразы РИФАМПИЦИНА ?

РИФАМПИЦИН связывается с бетта - цепью РНК-полимеразы необходимой для инициации и элонгации нити РНК

Что представляет собой СИГМА-ФАКТОР РНК-полимеразы E.Coli ?

СИГМА-ФАКТОР представляет собой специализированную субьединицу РНК-полимеразы, обеспечивающая интенсивную ТРАНСКРИПЦИЮ с отдельных матриц ДНК

Молекулярный вес 90.000 (одна полипептидная цепочка)

Определяет узнавание и интенсивное считывание нити ДНК РНК-полимеразой не с любого, а со строго определённых участков матрицы ДНК, соответствующих начальным зонам генов и оперонов. Инициирует синтез РНК

комплекс альфа и бетта' - субъединиц служит для специфического взаимодействия с промоторами - нуклеотидными последовательностями ДНК, детерминирующими инициацию транскрипции, функции омега - субъединицы не установлены.

Узнавание промоторов происходит только после присоединения к кор-ферменту сигма-фактора.

После инициации синтеза РНК сигма-субъединица отделяется от холо-фермента и дальнейшая транскрипция (элонгация цепи РНК) осуществляется кор-ферментом.

Как работает фермент РНК-полимераза, лишённая СИГМА-фактора ?

Лишенный СИГМА-ФАКТОРА фермент:

- связывается с большим количеством участков ДНК

- связывается очень непрочно

- беспорядочно и медленно катализирует синтез цепи РНК

Как работает полный фермент РНК-полимераза ?

ПОЛНЫЙ ФЕРМЕНТ РНК-полимераза, состоящий из КОР-ФЕРМЕНТА и СИГМА-ФАКТОРА;

- определяет узнавание со строго определённых участков ПРОМОТОРОВ;

- осуществляет тем самым интенсивное считывание нити ДНК со строго определённых участков матрицы ДНК, соответствующих начальным зонам генов и оперонов;

- инициирует синтез РНК

Какова функция недавно обнаруженного ПСИ-ФАКТОРА РНК-полимеразы E.Coli

Узнающий фактор ПСИ

- действует не подменяя или заменяя функцию СИГМА-ФАКТОРА;

- усиливает и дополняет действие СИГМА-ФАКТОРА так, что

РНК-полимераза с особенной интенсивностью транскрибирует цистрон,

кодирующий РИБОСОМАЛЬНЫЕ РНК

Каковы особенности транскрипции при заражении E.Coli фагом Т4 ?

После заражения бактериальной клетки фагом РНК-полимераза теряет свой СИГМА-ФАКТОР, а с ним и способность фермента узнавать определённые промоторы и инициировать синтез РНК с генов в ДНК E.Coli

При заражении E.Coli фагом Т4 КОР-ФЕРМЕНТ транскрибирует

ранний ген, в котором закодирован фаговый СИГМА-ФАКТОР,

который соединяется с КОР-ФЕРМЕНТОМ E.Coli и руководит

последовательной транскрипцией остальных генов

Преимущественно фаговых

К каким участкам ДНК РНК-полимераза обладает наибольшим сродством

Коротким одноцепочечным

Какими свойствами обусловлена особая селективность СИГМА ФАКТОРА к структурам ДНК ?

СИГМА-ФАКТОР обладает высоким отрицательным зарядом (ДНК тоже) и поэтому обладает высокой степенью селективности избирательности при взаимодействии РНК-полимеразы со структурой ПРОМОТОРА ДНК

Из каких последовательных стадий состоит процесс ТРАНСКРИПЦИИ ?

ИНИЦИАЦИЯ

ЭЛОНГАЦИЯ

ТЕРМИНАЦИЯ

Что такое промотор и из каких частей он состоит ?

ПРОМОТОРОМ начинается единица транскрипции;

ПРОМОТОР - участок ДНК. на котором происходит узнавание, посадка и связывание РНК-полимеразы;

ПРОМОТОР состоит из:

- области узнавания РНК полимеразой места своей посадки

- области ПЕРВИЧНОГО и ПРОЧНОГО связывания

Эту последнюю область многие рассматривают как уже зону ГЕНА-ОПЕРАТОРА или ОПЕРАТОРНУЮ ЗОНУ, с которой связываются белки-активаторы (положительно контролирующие элементы белки-репрессоры (отрицательно контролирующие элементы).

Но скорее это собственная зона ПРОМОТОРА

Опишите что такое ОПЕРОН ?

ОПЕРОН - зона ДНК, состоящая из:

- ПРОМОТОРА

- ОПЕРАТОРА

- ЗОНУ СТРУКТУРНЫХ ГЕНОВ - ОДНОГО ИЛИ НЕСКОЛЬКИХ ЦИСТРОНОВ

с которой списывается информация для функционального белка

- ТЕРМИНАТОРА

Что представляют собой ДВОЙНОЙ ЗАКРЫТЫЙ, ДВОЙНОЙ ОТКРЫТЫЙ

И ТРОЙНОЙ КОМПЛЕКСЫ ДНК ?

ДВОЙНОЙ ЗАКРЫТЫЙ КОМПЛЕКС - хеликс, двойная спираль ДНК

ДВОЙНОЙ ОТКРЫТЫЙ КОМПЛЕКС - участок расплетёного хеликса

с одноцепочечными участками ДНК (2-3 основания)

ТРОЙНОЙ КОМПЛЕКС ДНК - участок расплетёного хеликса

с одноцепочечным участком ДНК

РНК-полимеразой и нитью синтезированной РНК

123

Последнее изменение этой страницы: 2016-06-10

lectmania.ru. Все права принадлежат авторам данных материалов. В случае нарушения авторского права напишите нам сюда...